CITES DNA DATABASE FOR SHARK IDENTIFICATION

Project and database developped with Centro Ittiogenico marino of Tuscia University

Project Managar: Riccardo Sturla Avogadri & Silvia Cecchetti

Project name: CITES SHARK DNA DATABASE (CSDD)

Primary Marker: COI-5P Cytochrome Oxidase Subunit 1 5' Region

Supporting Marker/s: COI-5P Cytochrome Oxidase Subunit 1 5' Region

Campaign: Shark Academy No Profit

Project Description: Creazione di un database usando frammenti di DNA degli squali CITES per identificare le specie pescate, in vendita nei supermercati, spiaggiate o vendute nei ristoranti. Il Cytochrome un gene del DNA Mitocondriale, molto studiato per sgominare la pesca di frodo, in quanto utilizzato come marcatore per scoprire la specie di appartenenza.

Sotto un esempio di sequenza di frammento di DNA a 652pb (paia di basi)

dello squalo SMERIGLIO

      cctctattta atctttggtg catgggcagg aatagtggga acagccctaa gccttttaat

      tcgcgctgag ctgggtcagc ctggttccct cctaggcgac gatcagattt ataatgttat

      tgtaaccgcc catgcatttg taatgatttt ctttatagta atgcctgtga taattggggg

      ctttggaaac tgactagtac cattaataat tggtgcacca gatatggcct tccctcgaat

      aaataacata agtttctgac tcctccctcc ttcttttctc ctactcctag cttcggccgg

      agtcgaagca ggggctggta ctggctgaac ggtttaccct cccctagctg gcaacttagc

      acatgccggg gcctccgttg atctggctat cttttccctt cacctagcgg gtatctcttc

      aatcttagct tcaattaact tcattacaac tattattaat ataaaaccac cagcaatttc

      ccagtaccag acgcccctat ttgtgtgatc cattctagta acaactattc tccttctttt

      agccctccca gtacttgcag ccggcatcac aatactactc actgaccgaa atctaaatac

      aactttcttt gacccagcag gagggggaga ccctattctc taccaacact tg

 

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  1. marker Basking shark - Squalo elefante - Cetorhinus maximus

  2. marker Whale shark - Squalo balena - Rinchodon typus

  3. marker Great white shark - Squalo bianco - Carcharodon carcharias

  4. marker Porbeagle - Smeriglio - Lamna nasus

  5. marker Oceanic white tip - Longimano - Carcharhinus longimanus

  6. marker Great Hammerhead - Squalo martello maggiore - Sphyrna mokarran

  7. marker Scalopped Hammerhead - Squalo martello smerlato o festonato - Sphyrna lewini

  8. marker Smooth Hammerhead - Squalo martello - Sphyrna zygaena